ΜΚΒΒ104 (α΄ εξάμηνο σπουδών)
Λειτουργική Ανάλυση Γονιδίων: από τον Σχεδιασμό στο Έμβιο Σύστημα (Functional analysis of genes: from the design to the living system)
5 ECTS, 3 εβδομαδιαίες ώρες διδασκαλίας, φόρτος εργασίας: 125 ώρες
Αντικείμενο-στόχοι:
Κατανόηση μεθόδων και στρατηγικών της σύγχρονης έρευνας μέσα από παραδείγματα ανάπτυξης μοριακών εργαλείων, πρότυπων συστημάτων μελέτης και ολοκληρωμένης ανάλυσης σημαντικών πρωτεϊνών αναφοράς και εξοικείωση με μεθόδους υπολογιστικής και πειραματικής ανάλυσης στο εργαστήριο.
Θεματικές ενότητες:
[1] Επιλογή, χειρισμοί, τροποποίηση και έκφραση γονιδίων (Gene delineation, manipulation, and expression)
[2] Πρωτεϊνικές λειτουργίες και αλληλεπιδράσεις (Protein function and interactions)
[3] Οργανισμοί-μοντέλα (Model organisms)
[4] Εξοικείωση με μεθόδους υπολογιστικής ανάλυσης (Familiarization with computational methods)
Επιμέρους θέματα που διδάσκονται:
α) Επιλογή, χειρισμοί, τροποποίηση και έκφραση γονιδίων
Γενετική και γονιδιωματική μηχανική, Σχεδιασμοί μεταλλαξιγένεσης, Γονιδιακή στόχευση με CRISPR/Cas9, Ολιστικές προσεγγίσεις στη Γονιδιωματική-Αλληλούχιση Νέας Γενιάς
β) Πρωτεϊνικές λειτουργίες και αλληλεπιδράσεις
Δομή, δυναμική και μοριακή βάση λειτουργίας πρωτεϊνών: Βιομοριακές προσομοιώσεις: σχέση δομής-δυναμικής και λειτουργίας πρωτεϊνών, Βιομοριακή μηχανική: Εφαρμογές στον ορθολογικό σχεδιασμό βιομορίων/φαρμάκων με σύγχρονες μεθόδους μοριακών προσομοιώσεων, Εργαλεία βιοπληροφορικής-ανάλυση δεδομένων, Πειραματικές και υπολογιστικές προσεγγίσεις για τον δομικό χαρακτηρισμό πρωτεϊνών, Λειτουργική ανάλυση πρωτεϊνών: Πειραματικές μεθοδολογίες, Ολιστικές προσεγγίσεις στην πρωτεϊνική ανάλυση-Proteomics, Βασικές αρχές μικροσκοπίας – Εφαρμογές στη Βιολογική Έρευνα
γ) Οργανισμοί-μοντέλα
Οργανισμοί-μοντέλα: Το zebrafish στη βιολογική έρευνα, Το γενετικό μοντέλο yeast, Το γενετικό μοντέλο της Drosophila, Το ποντίκι στην Ιατροβιολογική Έρευνα
δ) Εξοικείωση με μεθόδους υπολογιστικής ανάλυσης
Βιοπληροφορική ανάλυση Βιολογικών Δεδομένων, Στατιστική ανάλυση πειραματικών δεδομένων
Πλατφόρμα ασύγχρονης τηλεκπαίδευσης: http://ecourse.uoi.gr/course/view.php?id=1815