Λειτουργική Ανάλυση Γονιδίων: από τον Σχεδιασμό στο Έμβιο Σύστημα (ΛΣΕΣ) (Functional analysis of genes: from the design to the living system), με βαρύτητα 5 ECTS, σύνολο ωρών διδασκαλίας 30 + 4 για βιβλιογραφικές παρουσιάσεις φοιτητών + >6 για εξοικείωση με πειραματικούς χειρισμούς και υπολογισμούς στο εργαστήριο

Στόχοι: Κατανόηση μεθόδων και στρατηγικών της σύγχρονης έρευνας μέσα από παραδείγματα ανάπτυξης μοριακών εργαλείων, πρότυπων συστημάτων μελέτης και ολοκληρωμένης ανάλυσης σημαντικών πρωτεϊνών αναφοράς και εξοικείωση με μεθόδους υπολογιστικής και πειραματικής ανάλυσης στο εργαστήριο.

Θεματικές ενότητες

[1] Επιλογή, χειρισμοί, τροποποίηση και έκφραση γονιδίων (Gene delineation, manipulation, and expression)

[2] Πρωτεϊνικές λειτουργίες και αλληλεπιδράσεις (Protein function and interactions)

[3] Οργανισμοί-μοντέλα (Model organisms)

[4] Εξοικείωση με μεθόδους υπολογιστικής ανάλυσης (Familiarization with computational methods)

Επιμέρους θέματα και (κατά προσέγγιση) ώρες διδασκαλίας: 

α) Επιλογή, χειρισμοί, τροποποίηση και έκφραση γονιδίων

Γενετική και γονιδιωματική μηχανική (2h), Σχεδιασμοί μεταλλαξιγένεσης (2h), Γονιδιακή στόχευση με CRISPR-Cas9 (2h). Άσκηση πειραματικού σχεδιασμού μεταλλαξιγένεσης (2h).

β) Πρωτεϊνικές λειτουργίες και αλληλεπιδράσεις

Λειτουργική ανάλυση πρωτεϊνών I: Ταυτοποίηση και ποιοτικός χαρακτηρισμός πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων (2h), II: Ποσοτικός χαρακτηρισμός πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων (2h), Άσκηση πειραματικού σχεδιασμού μελέτης πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων (2h), Ολιστικές προσεγγίσεις στην πρωτεϊνική ανάλυση-Proteomics (3h), Βασικές αρχές μικροσκοπίας – Εφαρμογές στη Βιολογική Έρευνα (2h), Δομή, δυναμική και μοριακή βάση λειτουργίας πρωτεϊνών: Εφαρμογή στον ορθολογικό σχεδιασμό φαρμάκων με σύγχρονες μεθόδους (2h).   

γ) Οργανισμοί-μοντέλα

Οργανισμοί-μοντέλα: Το zebrafish στη βιολογική έρευνα (2h), Το γενετικό μοντέλο yeast (2h), Το γενετικό μοντέλο της Drosophila (2h), Το ποντίκι στην Ιατροβιολογική Έρευνα (2h).

δ) Εξοικείωση με μεθόδους υπολογιστικής ανάλυσης

Βιοπληροφορική ανάλυση Βιολογικών Δεδομένων (2h), Στατιστική ανάλυση πειραματικών δεδομένων (3h).

Πλατφόρμα ασύγχρονης τηλεκπαίδευσης: http://ecourse.uoi.gr/course/view.php?id=1815

Περίγραμμα μαθήματος MKBB104

JSN Decor is designed by JoomlaShine.com